El orígen del Bouvier Des Flandres es algo complejo porque en realidad no se tiene con absoluta certeza su orígen. Lo que si es cierto, es que se originó en Europa en la región de Flandres, situada entre Bélgica y el norte de Francia.Por lo tanto, oficialmente el orígen es Franco-Belga. Esta situación Franco-Belga es debido a que en el pasado como es sabido, Europa sufrió muchas batallas debidas principalmente a la posesión de territorios y Bélgica se vió repetidamente involucrada en intensas luchas provocadas por franceses, austriacos, italianos, alemanes e ingleses.En la terminación de las batallas y la devolución o repartición de territorios, no se sabe con seguridad si esta raza se originó en el territorio de Flandres en Bélgica o en Francia.En varios libros y artículos atribuyen el orígen de esta raza a Bélgica debido a diversas pinturas, fotografías y dibujos que se han encontrado en periódicos, libros y museos.Así mismo, los Belgas eran considerados grandes granjeros y utilizaban perros para pastorear ganado y otras actividades.

Sabiendo el orígen del Bouvier, es importante conocer su descendencia y su historia a través de los años. El Bouvier proviene de una revoltura de razas en su mayoría perros de trabajo(unas no definidas) que lo hacen un excelente perro con vastas y diversas características. Se dice, que los ancestros del Bouvier eran utilizados principalmente como perros de defensa y guardia en las granjas realizando distintos trabajos de pastoreo y transportación de insumos como leche, quesos, carnes y verduras. El parecido físico de los ancestros del Bouvier no tienen ningún parecido con el actual debido a que como todo en la vida, hay cambios que mejorar. Entre los diversos tipos de razas que anteceden al Bouvier, se dice que el perro belga Matin, el perro tipo Griffón, el Pastor de Beauce y el perro tipo Barbet tuvieron mucha influencia con el actual Bouvier Des Flandres. Así mismo, en algunos artículos y libros se nombran diversos nombres como el Vuilbaard(barba sucia), Koehond(perro de vacas),Toucheur de Boeur(manejador de ganado)ó Pic. Se dice que estos fueron algunos nombres que se les dieron a los antecesores del Bouvier.

En realidad, la recuperación del Bouvier Des Flandres después de la PGM fue gracias a criadores holandeses que se preocuparon por buscar y reunir a los pocos ejemplares vivos que quedaron después de la guerra. En Holanda, el Bouvier tuvo mucha aceptación desde que se presentaron los primeros ejemplares en Bruselas a principios del siglo XX. Después de la PGM y con la recuperación de la raza, el Bouvier tuvo mucho auge en Bélgica, Francia y Holanda. Desgraciadamente solo fueron pocos años porque después estalló la Segunda Guerra Mundial(1938) y de nuevo el Bouvier sufrió la caída más dramática de toda su historia.Con perseverancia y devoción al Bouvier, diversos criadores buscaron y recuperaron muy pocos ejemplares en Holanda, Bélgica y Francia. Esta recuperación tan importante es debida a los criadores Justin Chastel y Felix Verbanck.

A partir de principios de los años 50, fue cuando el Bouvier emergió con intensidad hasta convertirse en lo que es el día de hoy:una raza admirada por muchos pero aceptada por pocos.